| Comparison of LC/MS data analysis tools |
| Date: 09.08.2006 | Project: Proteomics | Tutor(s) : Reinert / Schulz-Trieglaff | |
| Several software projects (MapQuant, TPP, MzMine) have been published that are direct competitors for OpenMS. The goal of this research project (Forschungspraktikum) is to compare two of these projects to OpenMS. | |||
Ablauf:
(1) Installieren der Softwarepakete, wenn möglich auf Unirechnern
(2) Sinnvolle Vergleichsmöglichkeiten finden (für uns ist besonders Quantifizierung von Peptiden und deren Identifizierung interessant)
(3) Bericht schreiben (Installationsprobleme beschrieben, wo liegt welches Programm, welche Vergleiche wurden angestellt, wie sind die Vergleiche ausgegangen, etc.)
(4) Ausbaumöglichkeiten, wenn mehr Zeit da ist: andere Softwarepakete hinzunehmen, mehr Daten (evtl. auch künstlich generierte mit bestimmen Eigenschaften oder starkem Rauschen
Quellen: