 02.04.2009 | |
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Wenn nicht anders angegeben finden die Veranstaltungen im Institut für Informatik, Takustraße 9, statt.
| Reinert Bockmayr Andreotti |
Thu Exercises:Tue | 10-12 08-10 | SR 006 Arnimallee 3 SR 119 | ||||
| Linear programming; Combinatorial optimization; Graph algorithms; Advanced data structures; Discrete modelling; RNA and protein structure analysis; Molecular evolution.
Target group: MSc students of Bioinformatics: In the new "Studienordnung": Pflichtmodul P1. In the old "Studienordnung": Can be used for areas C and D. Literature: tbd Exercises: There is an obligatory exercise for this lecture. A successfull participation will count as "aktive Teilnahme". There will be no marks for the exercises. First lecture: | ||||||
| Reinert |
UE: Wednesday | 10-12 | SR 055 | ||||
| Die Vorlesung gibt eine Einführung in grundlegende algorithmische Techniken und Datenstrukturen für Strings und Graphen. Dabei stehen bioinformatische Fragestellungen im Vordergrund. Zielgruppe: Pflichtveranstaltung für die Studenten im Bachelorstudiengang Bioinformatik, 3. Semester. Literatur: Die Folien der Vorlesung werden jeweils vor der Vorlesung ins Netz gestellt. Zusätzlich gibt es am Anfang jedes Kapitels eine Liste, in der die Quellen und Hintergrundliteratur zum jeweiligen Thema zu finden sind. Hier sind drei Bücher, die gut als Einführung geeignet sind (diese befinden sich auch im Handapparat der Fachbereichsbibliothek): Neil C. Jones, Pavel A. Pevzner: An Introduction to Bioinformatics Algorithms. MIT Press, Cambridge, MA, 2004. ISBN 0-262-10106-8 R. Durbin, S. Eddy, A. Krogh, G. Mitchison: Biological sequence analysis. Cambridge University Press, 1998. ISBN 0-521-62971-3 David B. Mount: Bioinformatics. Sequence and Genome Analysis. Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, 2001. ISBN 0-87969-608-7 First lecture: | ||||||
| Reinert, Döring |
| In the seminar we discuss important and recent research results in the field of algorithmic genome comparison. The seminar can be accounted under "Studienbereich" C or D. In the new MSC Regulations it is W2 B. The goal of the seminar is twofold: 1. The participants should get an insight of the current research in the field 2. The participants will practice to read original research articles, work through them and present the gist of it in a coherent form to the other participants. The mark will be given according to the quality of the slides, the oral representation and the level of participation.
Target group: MSc students | ||||||
| Reinert |
| In this seminar we will present original work in Computational biology as well as progress reports from PhD students. Master students can participate and are assigend a paper to present. If they talk about their masters thesis, no credits are awarded. Please sign up for the seminar on the group web page. Target group: Master and PhD students in Bioinformatics, Computer Science and Mathematics | ||||||
| Andreotti |
nachmittags | Übung: K 48 | |||||
| (Blockkurs)
Die Veranstaltung gibt eine Einführung in die Programmiersprache C/C++ für Studierende, die bereits über Grundkenntnisse einer imperativen Programmiersprache (wie z.B. Java) verfügen. Die Lehrinhalte werden durch Rechnerübungen vertieft.
Anmerkung: Bei dieser Veranstaltung kann lediglich ein unbenoteter Leistungsnachweis (2 ECTS credits) erworben werden. Zielgruppe: Studierende der Informatik oder Bioinformatik. | ||||||