Veranstaltungen WS 2004/2005

Lecture News
02.04.2009
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Wenn nicht anders angegeben finden die Veranstaltungen im Institut für Informatik, Takustraße 9, statt.

V Sequence Analysis IReinert
2 SWS19.10.04Tue 8:30-10Room 006
In this lecture we present several topics of practical relevance in the field of sequence analysis. In contrast to the Bachelor courses we aim at a deeper understanding of the algorithms and a more thorough analysis.

Target group: Master's students (max. 25)

Literature: see

(KVV)

Ü Sequence Analysis IDöring
2 SWS01.10.04Thu 8:30-10025/26 (Arnimallee 2-6)
In this lecture we present several topics of practical relevance in the field of sequence analysis. In contrast to the Bachelor courses we aim at a deeper understanding of the algorithms and a more thorough analysis. The lecture can be assigned to the Studienbereiche C and D. "Speicherung und Analyse von Genom- und Proteomdaten" and "Analyse und Visualisierung biologischer Massendaten". There will be a second part in the summer semester. (KVV)
V Algorithmen und Datenstrukturen für BioinformatikGröpl
2 SWS21.10.04Thu 14-16Room 005
Die Vorlesung gibt eine Einführung in grundlegende algorithmische Techniken und Datenstrukturen für Strings und Graphen. Dabei stehen bioinformatische Fragestellungen im Vordergrund.

Zielgruppe: Pflichtveranstaltung für die Studenten im Bachelorstudiengang Bioinformatik, 3. Semester.

Vorkenntnisse: Informatik A und B

Die Teilnahme an der ergänzenden Übung ist obligatorisch.

(KVV)

Ü Algorithmen und Datenstrukturen für BioinformatikGramse, Mohajer; Gröpl
2 SWS26.10.04 Tue 10-12
 Tue 10-12
 Tue 14-16
 Tue 16-18
Arnimallee 3, Raum 211
Arnimallee 2-6, Raum 009
Takustraße 9, Hörsaal (?)
Takustraße 9, Raum 006
Übungen zur Vorlesung "Algorithmen und Datenstrukturen für Bioinformatik". (KVV)
S Genome ComparisonReinert
2 SWS19.10.04Tue 14-16Room 053
In this seminar we will present original work from the field of Genome Comparison. This includes algorithms to index and compare large genomic sequences.

(max. 15 participants) (KVV)

S Journal Club Computational BiologyReinert
2 SWS21.10.04Thu 16:30-18:00Room 006
In this seminar we will present original work in Computational biology as well as progress reports from PhD students. Master students can participate and are assigned a paper to present. If they talk about their masters thesis, no credits are awarded.

Target group: Master and PhD students (max. 5) (KVV)

S PhylogeneticsReinert
2 SWS21.10.04Thu 14-16Room 006
In this seminar we read the book "Phylogenetics" by Charles Semple and Mike Steel. The seminar is assigned to the Studienbereiche "Analyse und Visualisierung biologischer Massendaten" and "Speicherung and analysis of genomic and proteomic data" and counts 5 credits. Since all participants are to work through the book, at each seminar, two speakers are drafted in a lotterie. Hence all participants have to be prepared always. Obviously I do not expect a polished talk. Rather the speaker should lead the discussion using his or her notes. Assume there are 15 spots (that means 30 talks). If there are 10 participants then there will be 3 lots each. Everybody is allowed to refuse a talk without giving a reason and nobody can be drawn in two consecutive weeks. The mark will be awarded as the medium value of all talks. Repeated absence or refusals to talk will lower the mark.

Target group: Master's students

Literature: Semple/Steel: Phylogenetics

(KVV)

K Programmierkurs C/C++Döring
2 SWS11.10.-15.10.0410-12
13-15, 15-17
005 (Takustraße 9)
017 (Arnimallee 2-6)
K48 (Takustraße 9)
Die Veranstaltung gibt eine umfassende Einführung in die Programmiersprache C und eine Einführung in die Grundlagen von C++ für Studierende, die bereits über Grundkenntnisse einer imperativen Programmiersprache (wie z.B. Java) verfügen. Die Lehrinhalte werden durch Rechnerübungen vertieft.

Anmerkung: Bei dieser Veranstaltung kann lediglich ein unbenoteter Leistungsnachweis erworben werden.

Zielgruppe: Studierende der Informatik oder Bioinformatik, insbesondere zur Vorbereitung auf die Vorlesungen Übersetzerbau und Betriebssysteme oder Veranstaltungen der Algorithmischen Bioinformatik. (max. 50 Teilnehmer)

*Link zur Evaluation*

(KVV)