 02.04.2009 | |
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Wenn nicht anders angegeben finden die Veranstaltungen im Institut für Informatik, Takustraße 9, statt.
| Reinert |
Th 10-12 | Room 006 | |||||
| In this lecture we present several topics of practical relevance in the field of sequence analysis. In contrast to the Bachelor courses we aim at a deeper understanding of the algorithms and a more thorough analysis. Among the topics will be * fast exact and approximate string matching * algorithms for multiple alignment * algorithms for genome comparison * motif search algorithms * algorithms that use combinatorial optimization It is planned to offer several master theses following this lecture. (if interested please consider also the Software Praktikum "Programmieren in SEQAN"). (KVV) | ||||||
| Gröpl |
Th 16-18 | T9 R006 | |||||
| These are the theoretical (2h, Th) and practical (2h, Tu) exercises for the lecture. (KVV) | ||||||
| Reinert |
| In this seminar we will talk about original publications in the field of computational biology that use combinatorial optimization methods. (KVV) | ||||||
| Reinert |
| In this seminar we will present original work from the field of Proteomics. This includes data base search using mass spectra as well as protein interaction networks and related topics. (KVV) | ||||||
| Döring |
| In dieser Vorlesung werden wir fortgeschrittene Aspekte der C/C++ Programmierung besprechen (Templates, STL, Code-Optimierung, usw.). Ziel ist die möglichst weitgehende Beherrschung dieser hochkomplexen Programmiersprache. Es wird angenommen, dass die Teilnehmer bereits über solide Grundkenntnisse in C/C++ verfügen. Interessierte Hörer aller Fachrichtungen sind herzlich willkommen. (KVV) | ||||||
| Döring |
| In diesem Praktikum werden Algorithmen zur Sequenzanalyse implementiert, und zwar im Rahmen Software-Bibliothek SEQAN, die zur Zeit in unserer Arbeitsgruppe entwickelt wird.
Begleitend dazu wird eine Vorlesung zur fortgeschrittenen C++ Programmierung angeboten. Diese Veranstaltung richtet sich ausschließlich an Studierende der Bioinformatik. | ||||||
| Döring |
Übung: 14-17 | Di: 005 (Takustr. 9) Mi: 055 (Takustr.9) Do: 005 (Takustr.9) 017 (Arnimallee 2-6) | |||||
| Dieser Blockkurs bietet einen schnellen Einstieg in die grundlegenden Konzepte der Programmiersprache C/C++ für Studenten, die möglichst bereits Grundkenntnisse über imperative Hochsprachen (wie z.B. VB, Java...) besitzen. Die Veranstaltung richtet sich an Studierende der Informatik/Bioinformatik. (KVV) | ||||||